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目前市面上常用的碳源：甲醇、乙酸、乙酸钠、面粉、葡萄糖、生物质碳源及污泥水解上清液等。在使用过程中，需要根据实际工程情况选择合适的碳源。
甲醇作为外碳源具有运行费用低和污泥产量小的优势，在甲醇碳源不足时，存在亚硝酸盐积累的现象。以甲醇为碳源时的反硝化速率比以葡萄糖为碳源时快3倍，其 碳氮比（COD：氨氮）为 2.8～3.2 。
但甲醇作为外加碳源时，有以下3点问题需关注：
甲醇易燃，为甲类危化品，储存和使用均有严格要求。特别是其储存需报当地公安部门备案审批，手续繁琐。
糖类碳源，以面粉、蔗糖、葡萄糖为主，由于葡萄糖是简单的糖，所以目前研究比较多。当碳源充足时，以葡萄糖为碳源的 碳氮比较甲醇为碳源时高得多，为 6∶1～7∶1。碳源对硝氮的比还原速率几乎没有影响，但是对亚硝氮的比积累速率影响较大，在研究中发现只有葡萄糖作为外加碳源时对亚硝氮的比累积速率没有影响。
以葡萄糖为代表的糖类物质作为外加碳源使得脱氮效果良好，可是，糖类作为多分子化合物，容易引起细菌的大量繁殖，导致污泥膨胀，增加出水中COD的值，影响出水水质，同时，与醇类碳源相比，糖类物质更容易产生亚硝态氮积累的现象。
但其弊端有二点：
需要现场配置成溶液，劳动强度大，投加精准性差，大型污水处理厂无法使用。
工业葡萄糖含杂质多，食品葡萄糖价格贵。
微生物常用的复合碳源物质分为有机碳源和无机碳源两种。有机碳源包括各种糖类、蛋白质、脂肪、有机酸等。微生物生长繁殖或积累代谢产物的营养基质。任何培养基中均需含有微生物所必需的能源、碳源、氮源、矿质元素、水和生长因素，但不同营养类型、不同种类的微生物对营养元素的要求又有很大差异。
随着社会的发展，净水药剂的种类也是越来越多，根据污水的成分的不同，我们需要选择不同的药剂来投加。污水厂水处理培菌碳源有工业面粉，尿素，磷肥，工业葡萄糖，乙酸钠等，今天我们要讲的就是新型复合碳源，这种复合碳源由多种有机物氨基酸组成，投加量少，可以起到快速培菌的作用，且使用后水质比较稳定。复合碳源用于促进反硝化脱氮异养菌群快速繁殖，提高微生物净化能力，生化系统处理能力和抗冲击力的一种新型复合性营养素。本品具有、快速、低耗、且生物友好的特点。
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